Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COG3Q96JB2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
COG3Q96JB2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms