Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCANQ96GW7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BCANQ96GW7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms