Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC51Q96ER9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms