Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG4CQ96DT6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG4CQ96DT6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms