Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE0

NUDT16, U8 snoRNA-decapping enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT16Q96DE0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NUDT16Q96DE0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDT16Q96DE0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms