Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ULK4Q96C45 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms