Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NKD2Q969F2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKD2Q969F2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms