Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD50Q92878 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD50Q92878 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms