Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRQ92752 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRQ92752 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRQ92752 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRQ92752 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNRQ92752 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNRQ92752 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNRQ92752 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNRQ92752 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNRQ92752 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNRQ92752 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNRQ92752 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNRQ92752 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNRQ92752 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNRQ92752 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TNRQ92752 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TNRQ92752 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TNRQ92752 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNRQ92752 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNRQ92752 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNRQ92752 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNRQ92752 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TNRQ92752 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNRQ92752 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNRQ92752 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNRQ92752 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TNRQ92752 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRQ92752 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRQ92752 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRQ92752 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRQ92752 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRQ92752 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRQ92752 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRQ92752 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRQ92752 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRQ92752 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRQ92752 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRQ92752 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRQ92752 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TNRQ92752 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRQ92752 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRQ92752 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRQ92752 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRQ92752 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRQ92752 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRQ92752 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRQ92752 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRQ92752 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRQ92752 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRQ92752 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRQ92752 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TNRQ92752 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRQ92752 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRQ92752 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRQ92752 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRQ92752 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRQ92752 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRQ92752 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRQ92752 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRQ92752 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRQ92752 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRQ92752 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRQ92752 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TNRQ92752 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNRQ92752 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNRQ92752 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNRQ92752 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNRQ92752 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNRQ92752 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNRQ92752 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TNRQ92752 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNRQ92752 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNRQ92752 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms