Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOPBP1Q92547 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TOPBP1Q92547 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TOPBP1Q92547 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms