Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PSPC1Q8WXF1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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