Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATRIPQ8WXE1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms