Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LMO7Q8WWI1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMO7Q8WWI1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms