Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFT2D1Q8WV19 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFT2D1Q8WV19 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms