Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HAVCR2Q8TDQ0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HAVCR2Q8TDQ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms