Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELQQ8TDG4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELQQ8TDG4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms