Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PNLDC1Q8NA58 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNLDC1Q8NA58 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms