Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms