Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC33Q8N5R6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC33Q8N5R6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.6 ms