Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00518Q8N0U6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms