Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMYD4Q8IYR2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMYD4Q8IYR2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMYD4Q8IYR2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD4Q8IYR2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD4Q8IYR2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD4Q8IYR2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD4Q8IYR2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD4Q8IYR2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD4Q8IYR2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD4Q8IYR2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD4Q8IYR2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMYD4Q8IYR2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms