Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2BQ7L1I2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms