Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
USP53Q70EK8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms