Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TPGS1Q6ZTW0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms