Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDZRN4Q6ZMN7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms