Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCD3Q6STE5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMARCD3Q6STE5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms