Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ZCCHC12Q6PEW1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZCCHC12Q6PEW1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms