Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms