Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40BQ6NWY9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40BQ6NWY9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms