Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LHX8Q68G74 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LHX8Q68G74 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms