Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
WSCD1Q658N2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms