Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PAPD7Q5XG87 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAPD7Q5XG87 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms