Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM29Q5VYK3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms