Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SAMD13Q5VXD3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD13Q5VXD3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms