Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf53Q5VUE5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms