Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF38BQ5VTL8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPF38BQ5VTL8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPF38BQ5VTL8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms