Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
STRIP1Q5VSL9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STRIP1Q5VSL9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms