Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C12orf60Q5U649 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C12orf60Q5U649 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms