Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MARCH8Q5T0T0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MARCH8Q5T0T0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms