Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CELF3Q5SZQ8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms