Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FRMPD1Q5SYB0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms