Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM47AQ5JRC9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms