Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC4Q5GLZ8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms