Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KHDC3LQ587J8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KHDC3LQ587J8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms