Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TDRD12Q587J7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms