Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COBLL1Q53SF7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COBLL1Q53SF7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COBLL1Q53SF7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COBLL1Q53SF7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COBLL1Q53SF7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COBLL1Q53SF7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COBLL1Q53SF7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COBLL1Q53SF7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms