Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACSM3Q53FZ2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms