Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK1Q52WX2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms