Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GREB1Q4ZG55 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GREB1Q4ZG55 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms