Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NBPF1Q3BBV0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF1Q3BBV0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms